Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CGNL1Q0VF96 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms