Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP4Q09028 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms