Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC1Q08554 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms