Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms