Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRF8Q02556 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.4 ms