Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms