Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPL23P62829 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPL23P62829 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms