Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms