Protein–RNA interactions for Protein: P59046

NLRP12, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,061 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP12P59046 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NLRP12P59046 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NLRP12P59046 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NLRP12P59046 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
NLRP12P59046 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NLRP12P59046 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NLRP12P59046 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NLRP12P59046 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NLRP12P59046 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NLRP12P59046 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NLRP12P59046 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
NLRP12P59046 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
NLRP12P59046 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NLRP12P59046 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NLRP12P59046 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NLRP12P59046 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NLRP12P59046 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NLRP12P59046 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms