Protein–RNA interactions for Protein: P57082

TBX4, T-box transcription factor TBX4, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX4P57082 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TBX4P57082 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TBX4P57082 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TBX4P57082 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TBX4P57082 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TBX4P57082 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TBX4P57082 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TBX4P57082 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TBX4P57082 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TBX4P57082 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TBX4P57082 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TBX4P57082 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TBX4P57082 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TBX4P57082 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBX4P57082 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBX4P57082 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBX4P57082 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBX4P57082 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBX4P57082 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBX4P57082 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBX4P57082 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBX4P57082 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBX4P57082 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBX4P57082 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBX4P57082 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBX4P57082 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBX4P57082 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBX4P57082 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBX4P57082 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBX4P57082 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBX4P57082 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBX4P57082 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBX4P57082 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBX4P57082 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBX4P57082 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBX4P57082 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBX4P57082 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBX4P57082 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBX4P57082 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBX4P57082 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBX4P57082 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBX4P57082 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBX4P57082 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBX4P57082 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBX4P57082 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBX4P57082 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBX4P57082 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBX4P57082 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBX4P57082 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBX4P57082 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBX4P57082 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBX4P57082 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBX4P57082 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBX4P57082 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBX4P57082 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBX4P57082 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBX4P57082 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBX4P57082 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBX4P57082 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBX4P57082 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBX4P57082 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBX4P57082 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBX4P57082 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBX4P57082 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBX4P57082 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBX4P57082 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBX4P57082 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBX4P57082 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBX4P57082 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBX4P57082 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBX4P57082 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBX4P57082 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBX4P57082 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBX4P57082 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBX4P57082 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBX4P57082 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBX4P57082 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBX4P57082 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBX4P57082 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBX4P57082 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBX4P57082 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBX4P57082 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TBX4P57082 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TBX4P57082 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TBX4P57082 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBX4P57082 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBX4P57082 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBX4P57082 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBX4P57082 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TBX4P57082 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TBX4P57082 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBX4P57082 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBX4P57082 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBX4P57082 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBX4P57082 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBX4P57082 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBX4P57082 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBX4P57082 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBX4P57082 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBX4P57082 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms