Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOSBP53539 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOSBP53539 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOSBP53539 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOSBP53539 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOSBP53539 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOSBP53539 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOSBP53539 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOSBP53539 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOSBP53539 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOSBP53539 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOSBP53539 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOSBP53539 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOSBP53539 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOSBP53539 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOSBP53539 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FOSBP53539 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FOSBP53539 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FOSBP53539 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FOSBP53539 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FOSBP53539 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FOSBP53539 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOSBP53539 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOSBP53539 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOSBP53539 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOSBP53539 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FOSBP53539 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOSBP53539 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOSBP53539 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOSBP53539 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOSBP53539 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOSBP53539 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOSBP53539 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOSBP53539 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOSBP53539 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOSBP53539 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOSBP53539 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOSBP53539 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOSBP53539 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOSBP53539 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOSBP53539 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOSBP53539 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOSBP53539 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOSBP53539 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOSBP53539 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOSBP53539 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOSBP53539 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOSBP53539 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FOSBP53539 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FOSBP53539 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOSBP53539 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOSBP53539 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOSBP53539 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOSBP53539 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOSBP53539 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOSBP53539 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOSBP53539 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOSBP53539 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOSBP53539 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOSBP53539 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOSBP53539 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOSBP53539 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOSBP53539 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOSBP53539 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOSBP53539 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOSBP53539 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOSBP53539 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOSBP53539 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOSBP53539 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOSBP53539 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOSBP53539 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOSBP53539 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOSBP53539 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOSBP53539 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOSBP53539 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FOSBP53539 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOSBP53539 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOSBP53539 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOSBP53539 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FOSBP53539 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOSBP53539 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOSBP53539 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOSBP53539 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOSBP53539 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOSBP53539 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FOSBP53539 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOSBP53539 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOSBP53539 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOSBP53539 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOSBP53539 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOSBP53539 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOSBP53539 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOSBP53539 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOSBP53539 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FOSBP53539 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOSBP53539 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOSBP53539 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOSBP53539 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FOSBP53539 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOSBP53539 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms