Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DAP3P51398 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DAP3P51398 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms