Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNTAP49354 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNTAP49354 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNTAP49354 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNTAP49354 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNTAP49354 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNTAP49354 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNTAP49354 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNTAP49354 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNTAP49354 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNTAP49354 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FNTAP49354 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNTAP49354 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNTAP49354 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNTAP49354 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNTAP49354 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNTAP49354 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNTAP49354 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNTAP49354 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNTAP49354 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNTAP49354 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNTAP49354 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNTAP49354 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNTAP49354 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNTAP49354 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNTAP49354 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNTAP49354 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNTAP49354 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNTAP49354 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNTAP49354 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNTAP49354 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNTAP49354 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNTAP49354 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNTAP49354 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNTAP49354 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNTAP49354 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNTAP49354 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNTAP49354 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNTAP49354 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNTAP49354 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNTAP49354 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNTAP49354 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNTAP49354 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNTAP49354 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNTAP49354 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNTAP49354 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNTAP49354 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNTAP49354 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNTAP49354 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNTAP49354 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNTAP49354 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNTAP49354 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNTAP49354 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNTAP49354 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FNTAP49354 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FNTAP49354 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FNTAP49354 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FNTAP49354 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNTAP49354 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNTAP49354 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNTAP49354 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNTAP49354 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNTAP49354 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNTAP49354 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNTAP49354 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNTAP49354 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNTAP49354 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNTAP49354 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNTAP49354 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTAP49354 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTAP49354 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTAP49354 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTAP49354 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTAP49354 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTAP49354 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTAP49354 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTAP49354 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTAP49354 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTAP49354 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTAP49354 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTAP49354 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTAP49354 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTAP49354 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTAP49354 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTAP49354 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTAP49354 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTAP49354 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTAP49354 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTAP49354 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTAP49354 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTAP49354 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTAP49354 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTAP49354 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTAP49354 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTAP49354 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTAP49354 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTAP49354 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTAP49354 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTAP49354 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTAP49354 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms