Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA8P48165 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA8P48165 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA8P48165 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA8P48165 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA8P48165 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA8P48165 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA8P48165 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA8P48165 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA8P48165 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA8P48165 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA8P48165 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA8P48165 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA8P48165 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA8P48165 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA8P48165 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA8P48165 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA8P48165 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA8P48165 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA8P48165 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA8P48165 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA8P48165 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA8P48165 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA8P48165 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA8P48165 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA8P48165 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA8P48165 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA8P48165 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA8P48165 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA8P48165 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA8P48165 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA8P48165 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA8P48165 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA8P48165 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA8P48165 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA8P48165 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA8P48165 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA8P48165 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA8P48165 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA8P48165 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA8P48165 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA8P48165 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA8P48165 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA8P48165 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA8P48165 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA8P48165 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJA8P48165 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJA8P48165 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJA8P48165 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJA8P48165 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GJA8P48165 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GJA8P48165 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJA8P48165 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJA8P48165 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJA8P48165 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJA8P48165 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJA8P48165 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJA8P48165 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJA8P48165 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJA8P48165 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJA8P48165 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GJA8P48165 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GJA8P48165 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJA8P48165 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJA8P48165 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJA8P48165 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJA8P48165 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJA8P48165 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJA8P48165 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJA8P48165 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GJA8P48165 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJA8P48165 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJA8P48165 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJA8P48165 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJA8P48165 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJA8P48165 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJA8P48165 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJA8P48165 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJA8P48165 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJA8P48165 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJA8P48165 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJA8P48165 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJA8P48165 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJA8P48165 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJA8P48165 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJA8P48165 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJA8P48165 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJA8P48165 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJA8P48165 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJA8P48165 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJA8P48165 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJA8P48165 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJA8P48165 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJA8P48165 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJA8P48165 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJA8P48165 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GJA8P48165 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJA8P48165 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJA8P48165 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJA8P48165 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms