Protein–RNA interactions for Protein: P41597

CCR2, C-C chemokine receptor type 2, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR2P41597 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR2P41597 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR2P41597 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR2P41597 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR2P41597 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR2P41597 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR2P41597 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR2P41597 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR2P41597 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR2P41597 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR2P41597 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR2P41597 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR2P41597 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR2P41597 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR2P41597 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR2P41597 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR2P41597 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR2P41597 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR2P41597 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR2P41597 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR2P41597 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR2P41597 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR2P41597 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR2P41597 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR2P41597 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR2P41597 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR2P41597 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR2P41597 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR2P41597 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR2P41597 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR2P41597 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR2P41597 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR2P41597 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR2P41597 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR2P41597 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR2P41597 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR2P41597 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR2P41597 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR2P41597 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR2P41597 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR2P41597 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR2P41597 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR2P41597 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR2P41597 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR2P41597 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR2P41597 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR2P41597 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR2P41597 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR2P41597 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR2P41597 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR2P41597 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR2P41597 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR2P41597 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR2P41597 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR2P41597 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR2P41597 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR2P41597 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR2P41597 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR2P41597 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR2P41597 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR2P41597 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR2P41597 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR2P41597 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR2P41597 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR2P41597 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR2P41597 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR2P41597 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR2P41597 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR2P41597 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR2P41597 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR2P41597 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR2P41597 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR2P41597 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR2P41597 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR2P41597 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR2P41597 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR2P41597 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR2P41597 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR2P41597 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR2P41597 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR2P41597 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR2P41597 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR2P41597 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR2P41597 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR2P41597 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR2P41597 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR2P41597 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR2P41597 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR2P41597 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR2P41597 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR2P41597 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR2P41597 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR2P41597 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR2P41597 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR2P41597 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR2P41597 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR2P41597 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR2P41597 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR2P41597 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCR2P41597 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms