Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ECHS1P30084 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms