Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLD1P28340 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLD1P28340 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLD1P28340 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLD1P28340 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLD1P28340 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLD1P28340 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLD1P28340 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLD1P28340 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLD1P28340 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLD1P28340 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
POLD1P28340 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLD1P28340 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLD1P28340 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLD1P28340 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
POLD1P28340 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLD1P28340 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLD1P28340 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLD1P28340 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLD1P28340 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLD1P28340 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLD1P28340 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLD1P28340 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLD1P28340 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLD1P28340 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLD1P28340 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLD1P28340 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLD1P28340 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLD1P28340 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLD1P28340 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLD1P28340 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLD1P28340 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLD1P28340 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
POLD1P28340 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLD1P28340 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLD1P28340 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLD1P28340 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLD1P28340 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLD1P28340 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
POLD1P28340 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLD1P28340 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLD1P28340 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLD1P28340 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLD1P28340 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLD1P28340 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLD1P28340 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
POLD1P28340 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLD1P28340 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLD1P28340 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLD1P28340 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLD1P28340 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLD1P28340 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLD1P28340 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLD1P28340 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
POLD1P28340 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
POLD1P28340 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLD1P28340 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLD1P28340 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLD1P28340 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLD1P28340 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLD1P28340 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLD1P28340 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLD1P28340 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLD1P28340 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLD1P28340 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLD1P28340 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLD1P28340 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLD1P28340 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLD1P28340 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLD1P28340 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
POLD1P28340 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLD1P28340 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLD1P28340 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLD1P28340 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLD1P28340 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLD1P28340 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLD1P28340 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLD1P28340 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
POLD1P28340 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLD1P28340 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
POLD1P28340 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLD1P28340 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLD1P28340 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
POLD1P28340 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
POLD1P28340 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLD1P28340 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLD1P28340 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLD1P28340 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLD1P28340 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLD1P28340 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLD1P28340 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLD1P28340 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLD1P28340 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
POLD1P28340 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLD1P28340 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLD1P28340 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLD1P28340 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLD1P28340 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLD1P28340 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLD1P28340 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms