Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB4P28070 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms