Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
XPAP23025 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
XPAP23025 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
XPAP23025 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
XPAP23025 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
XPAP23025 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
XPAP23025 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
XPAP23025 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
XPAP23025 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
XPAP23025 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
XPAP23025 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
XPAP23025 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
XPAP23025 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
XPAP23025 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
XPAP23025 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
XPAP23025 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
XPAP23025 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
XPAP23025 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
XPAP23025 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
XPAP23025 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
XPAP23025 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
XPAP23025 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
XPAP23025 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
XPAP23025 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
XPAP23025 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
XPAP23025 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XPAP23025 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
XPAP23025 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
XPAP23025 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
XPAP23025 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
XPAP23025 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
XPAP23025 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
XPAP23025 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
XPAP23025 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
XPAP23025 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
XPAP23025 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
XPAP23025 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
XPAP23025 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
XPAP23025 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
XPAP23025 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
XPAP23025 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
XPAP23025 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
XPAP23025 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
XPAP23025 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms