Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GM2AP17900 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GM2AP17900 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GM2AP17900 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GM2AP17900 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GM2AP17900 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GM2AP17900 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GM2AP17900 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GM2AP17900 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GM2AP17900 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GM2AP17900 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GM2AP17900 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GM2AP17900 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GM2AP17900 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GM2AP17900 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GM2AP17900 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GM2AP17900 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GM2AP17900 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GM2AP17900 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GM2AP17900 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GM2AP17900 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GM2AP17900 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GM2AP17900 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GM2AP17900 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GM2AP17900 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GM2AP17900 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GM2AP17900 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GM2AP17900 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GM2AP17900 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GM2AP17900 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GM2AP17900 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GM2AP17900 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GM2AP17900 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GM2AP17900 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GM2AP17900 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GM2AP17900 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GM2AP17900 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GM2AP17900 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GM2AP17900 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GM2AP17900 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GM2AP17900 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GM2AP17900 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GM2AP17900 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GM2AP17900 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GM2AP17900 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GM2AP17900 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GM2AP17900 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GM2AP17900 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GM2AP17900 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GM2AP17900 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GM2AP17900 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GM2AP17900 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GM2AP17900 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GM2AP17900 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GM2AP17900 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GM2AP17900 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GM2AP17900 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GM2AP17900 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GM2AP17900 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GM2AP17900 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GM2AP17900 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GM2AP17900 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GM2AP17900 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GM2AP17900 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GM2AP17900 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GM2AP17900 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GM2AP17900 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GM2AP17900 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GM2AP17900 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GM2AP17900 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GM2AP17900 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GM2AP17900 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GM2AP17900 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GM2AP17900 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GM2AP17900 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GM2AP17900 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GM2AP17900 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GM2AP17900 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GM2AP17900 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GM2AP17900 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GM2AP17900 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GM2AP17900 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GM2AP17900 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GM2AP17900 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GM2AP17900 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GM2AP17900 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GM2AP17900 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GM2AP17900 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GM2AP17900 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GM2AP17900 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GM2AP17900 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GM2AP17900 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GM2AP17900 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GM2AP17900 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GM2AP17900 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GM2AP17900 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GM2AP17900 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GM2AP17900 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GM2AP17900 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GM2AP17900 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms