Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTPS1P17812 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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