Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA4P13612 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms