Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEFHP12036 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEFHP12036 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEFHP12036 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEFHP12036 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEFHP12036 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEFHP12036 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEFHP12036 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEFHP12036 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEFHP12036 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEFHP12036 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEFHP12036 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEFHP12036 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEFHP12036 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEFHP12036 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEFHP12036 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEFHP12036 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEFHP12036 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEFHP12036 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEFHP12036 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEFHP12036 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEFHP12036 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NEFHP12036 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEFHP12036 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEFHP12036 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEFHP12036 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEFHP12036 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEFHP12036 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEFHP12036 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEFHP12036 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEFHP12036 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEFHP12036 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEFHP12036 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEFHP12036 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEFHP12036 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEFHP12036 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEFHP12036 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEFHP12036 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEFHP12036 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEFHP12036 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEFHP12036 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEFHP12036 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEFHP12036 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEFHP12036 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEFHP12036 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NEFHP12036 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEFHP12036 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEFHP12036 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEFHP12036 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEFHP12036 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEFHP12036 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEFHP12036 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEFHP12036 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEFHP12036 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEFHP12036 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NEFHP12036 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEFHP12036 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEFHP12036 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEFHP12036 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEFHP12036 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEFHP12036 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEFHP12036 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEFHP12036 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NEFHP12036 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEFHP12036 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEFHP12036 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NEFHP12036 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEFHP12036 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NEFHP12036 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEFHP12036 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEFHP12036 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEFHP12036 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEFHP12036 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEFHP12036 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NEFHP12036 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEFHP12036 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEFHP12036 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEFHP12036 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEFHP12036 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEFHP12036 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEFHP12036 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEFHP12036 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEFHP12036 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEFHP12036 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEFHP12036 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEFHP12036 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEFHP12036 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NEFHP12036 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEFHP12036 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEFHP12036 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEFHP12036 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEFHP12036 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NEFHP12036 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEFHP12036 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEFHP12036 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEFHP12036 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEFHP12036 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEFHP12036 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEFHP12036 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEFHP12036 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 207.6 ms