Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms