Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GLI1P08151 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GLI1P08151 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GLI1P08151 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GLI1P08151 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI1P08151 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI1P08151 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI1P08151 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI1P08151 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI1P08151 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI1P08151 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI1P08151 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI1P08151 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI1P08151 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI1P08151 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI1P08151 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI1P08151 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI1P08151 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI1P08151 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI1P08151 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI1P08151 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI1P08151 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI1P08151 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI1P08151 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI1P08151 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI1P08151 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI1P08151 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI1P08151 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI1P08151 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI1P08151 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI1P08151 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI1P08151 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI1P08151 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI1P08151 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI1P08151 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI1P08151 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI1P08151 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI1P08151 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI1P08151 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI1P08151 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI1P08151 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI1P08151 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI1P08151 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI1P08151 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI1P08151 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GLI1P08151 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms