Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms