Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms