Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPAG9O60271 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms