Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC1O14908 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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