Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms