Protein–RNA interactions for Protein: A6NHC0

CAPN8, Calpain-8, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN8A6NHC0 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPN8A6NHC0 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms