Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CFAP69A5D8W1 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms