Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms