Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
BIVM-ERCC5R4GMW8 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BIVM-ERCC5R4GMW8 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BIVM-ERCC5R4GMW8 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BIVM-ERCC5R4GMW8 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BIVM-ERCC5R4GMW8 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BIVM-ERCC5R4GMW8 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BIVM-ERCC5R4GMW8 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
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