Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms