Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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SH3BP1Q9Y3L3 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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