Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms