Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHKBQ9Y259 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.8 ms