Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HPS5Q9UPZ3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms