Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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SNX6Q9UNH7 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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SNX6Q9UNH7 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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SNX6Q9UNH7 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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SNX6Q9UNH7 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX6Q9UNH7 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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SNX6Q9UNH7 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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SNX6Q9UNH7 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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