Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms