Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms