Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII6

DUSP13, Dual specificity protein phosphatase 13 isoform B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP13Q9UII6 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP13Q9UII6 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms