Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLIP2Q9UDT6 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms