Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms