Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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