Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMEM30AQ9NV96 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMEM30AQ9NV96 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMEM30AQ9NV96 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMEM30AQ9NV96 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMEM30AQ9NV96 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMEM30AQ9NV96 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMEM30AQ9NV96 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMEM30AQ9NV96 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMEM30AQ9NV96 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMEM30AQ9NV96 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMEM30AQ9NV96 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM30AQ9NV96 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM30AQ9NV96 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM30AQ9NV96 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM30AQ9NV96 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM30AQ9NV96 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM30AQ9NV96 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM30AQ9NV96 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM30AQ9NV96 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM30AQ9NV96 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM30AQ9NV96 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM30AQ9NV96 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM30AQ9NV96 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM30AQ9NV96 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM30AQ9NV96 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM30AQ9NV96 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms