Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms