Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms