Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms